A Fog Assisted Cloud Paradigm for accessibility and collaboration to Genomic Data Analysis

Abstract

La secuenciación de la próxima generación es cada vez más creciente y requiere recursos informáticos a gran escala para manejar la enorme cantidad de datos producidos. El paradigma Cloud computing fácilmente maneja datos enormes, pero el problema central con este paradigma es la transferencia de datos enormes hacia y desde las computadoras en cloud debido al ancho de banda limitado que radica en la naturaleza centralizada de la arquitectura Cloud computing la cual está localizada lejos de los usuarios. Una arquitectura donde la potencia de computación se distribuyade manera más uniforme en toda la red es una forma de combatir este problema. La arquitectura debe llevar la capacidad de procesamiento hacia el borde de la red, más cerca de la fuente de los datos. Para esta propuesta, Fog computing ofrece una solución prometedora para acercar las capacidades computacionales a los datos generados y será la solución para ganar fuerza en la investigación genómica. Proponemos un nuevo modelo llamado Collaborative-Fog (Co-Fog) que adopta los paradigmas Fog y Cloudcomputing para administrar grandes conjuntos de datos genómicos y para permitir la comprensión de cómo las partes interesadas pueden gestionar la interacción y la colaboración. El presente trabajo describe el modelo Co-Fog que promete un mayor rendimiento, eficiencia energética, menor latencia, tiempo de respuesta más rápido, escalabilidad y una mejor precisión localizada para futuras colaboraciones a gran escala en la genómica.